Gravearbejde og de konstruktioner, som kommer til at udgøre den faste forbindelse, vil påvirke havbunden, hvor der findes forskellige bundformer. Derfor kortlægger man nu bundformerne og undersøger deres naturlige samspil med strømforholdene.

Strøm og bundmateriale i tæt samspil
Strømmen tæt ved bunden i Femern Bælt er stærk nok til, at havbundsmateriale som sand og grus bevæger sig med strømmen – specielt under og efter stormvejr. Også bølger kan sætte havbundsmaterialet i bevægelse. Sandbølger og sandbanker dannes ved erosion og aflejring af det løse bundmateriale i et kompliceret samspil mellem sediment, strøm og bølger. Denne interaktion er med til at skabe de flotte rytmiske mønstre og former, som dækker en del af havbunden i Femern Bælt.

Avanceret kortlægning med ekkolod
Med et avanceret flerstrålet ekkolod, en såkaldt multibeam echo sounder, har eksperter gennemført en højtopløselig dybdeopmåling med mindre end 1 m mellem målepunkterne.     

På baggrund af dybdeopmålingerne er der udarbejdet kort, som viser, hvor dybt de forskellige typer af bundformer ligger. Kortene viser samtidigt deres skiftende hældninger.

Strømningsmodel giver svar
I alle områder med bundformer er denne modstand beregnet ved hjælp af en detaljeret strømningsmodel, som kan beregne strømhvirvlerne. Strømningsmodstanden fra bundformerne er anvendt til at beregne, hvordan de påvirker strømmen igennem bæltet. De måneformede sandbanker har for små bundhældninger til at påvirke strømmen væsentligt.

Nogle af de andre typer af sandbanker og sandbølger har større bundhældning, men da de trods alt kun dækker et begrænset område på bunden, viser undersøgelserne, at bundformernes indflydelse på vandstrømmen gennem Femern Bælt totalt set er lille.